输卵管囊肿治疗后存在一定的复发可能性。如果囊肿是由盆腔炎症或子宫内膜异位症引起的，炎症没有彻底消除或者相关病灶没有完全处理，囊肿可能在原位置或附近再次出现。例如，输卵管伞端粘连问题未解决，管腔内液体可能再次积聚形成囊肿。

复发的风险还与个人体质、术后护理以及是否存在基础疾病有关。手术后如果没有遵医嘱进行规范的抗炎治疗，或者过早恢复高强度活动，都可能增加复发概率。部分先天性因素导致的囊肿，若手术中未能完全切除残留组织，也可能再次形成囊性结构。

为了降低复发风险，患者术后应积极治疗原发疾病，比如控制炎症或调节内分泌，同时保持健康的生活方式，定期复查超声，一旦发现异常及时干预。