输卵管囊肿可能影响怀孕，但并非所有患者都会不孕。较小囊肿（直径小于3厘米）若未压迫输卵管或卵巢，通常不影响正常排卵和受精过程，女性仍可能自然受孕。

当囊肿体积较大时，可能压迫输卵管导致管腔堵塞，阻碍精卵结合。若合并感染引发输卵管积水，会进一步降低受孕成功率。囊肿扭转或破裂还可能引发急性腹痛，增加宫外孕风险。

备孕女性发现囊肿后，建议通过超声评估大小和位置。医生会根据囊肿对生殖功能的影响制定方案，必要时治疗后科学备孕，以提高受孕几率。